Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms