Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HKR1P10072 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HKR1P10072 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HKR1P10072 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms