Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms