Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL41O60662 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL41O60662 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms