Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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