Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms