Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII6

DUSP13, Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13Q9UII6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP13Q9UII6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms