Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 SEPT9-205ENST00000427674 3937 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.488e-7■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 GOLGA4-203ENST00000419177 760 ntTSL 316.67■□□□□ 0.264e-7■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.17e-7■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.017e-7■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 AGFG2-203ENST00000430857 915 ntTSL 525.86■■□□□ 1.737e-7■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 AGFG2-205ENST00000477022 1327 ntTSL 1 (best)20.53■□□□□ 0.887e-7■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.513e-10■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.873e-10■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 NAP1L1-206ENST00000544816 1597 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.492e-6■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 NAP1L1-210ENST00000547773 1967 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.552e-6■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 NAP1L1-205ENST00000542344 1675 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 NAP1L1-203ENST00000431879 2031 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.762e-6■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 NAP1L1-216ENST00000549596 1838 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 NAP1L1-213ENST00000548044 1339 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.342e-6■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.72e-6■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 ELOVL1-211ENST00000482302 984 ntTSL 319.46■□□□□ 0.714e-8■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 ELOVL1-207ENST00000470968 867 ntTSL 518.79■□□□□ 0.64e-8■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 ELOVL1-206ENST00000470769 1215 ntTSL 215.69■□□□□ 0.14e-8■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 ELOVL1-203ENST00000464204 1034 ntTSL 1 (best)15.38■□□□□ 0.054e-8■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.034e-8■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 ELOVL1-212ENST00000487209 828 ntTSL 214.51□□□□□ -0.094e-8■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 ELOVL1-214ENST00000497050 973 ntTSL 213.79□□□□□ -0.24e-8■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 ELOVL1-209ENST00000479439 646 ntTSL 513.79□□□□□ -0.24e-8■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 ELOVL1-216ENST00000621943 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.264e-8■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 ELOVL1-215ENST00000497569 830 ntTSL 313.03□□□□□ -0.324e-8■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 ELOVL1-213ENST00000496932 779 ntTSL 312.79□□□□□ -0.364e-8■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 ELOVL1-210ENST00000479686 417 ntTSL 312.69□□□□□ -0.384e-8■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 ELOVL1-204ENST00000465321 726 ntTSL 512.54□□□□□ -0.44e-8■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 ELOVL1-202ENST00000413844 1451 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.464e-8■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.063e-6■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 PPP2R5E-203ENST00000553266 1690 ntTSL 1 (best)19.61■□□□□ 0.733e-6■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.183e-6■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 PPP2R5E-207ENST00000556878 3371 ntTSL 1 (best)12.99□□□□□ -0.333e-6■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.293e-6■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.213e-6■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 FAM193A-207ENST00000512465 4663 ntTSL 1 (best)12.16□□□□□ -0.463e-6■■■■□ 20.9
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RBM22Q9NW64 FAM193A-210ENST00000545951 3987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.933e-6■■■■□ 20.9
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RBM22Q9NW64 FAM193A-203ENST00000502458 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.023e-6■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 FAM193A-204ENST00000505311 4110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.053e-6■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.21e-20■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.151e-20■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.832e-6■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.868e-10■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 SRSF4-206ENST00000605204 1399 ntTSL 1 (best)19.33■□□□□ 0.698e-10■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 SRSF4-202ENST00000466448 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.64■□□□□ 0.578e-10■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 SRSF4-208ENST00000634348 8128 ntTSL 511.36□□□□□ -0.598e-10■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 CYP2W1-203ENST00000415893 890 ntTSL 318.2■□□□□ 0.51e-31■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.339e-11■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 SNHG12-201ENST00000461448 1629 ntTSL 1 (best)19.86■□□□□ 0.779e-11■■■■□ 20.9
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RBM22Q9NW64 SNHG12-206ENST00000474814 1903 ntTSL 218.04■□□□□ 0.489e-11■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.069e-11■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 SNHG12-209ENST00000481368 1588 ntTSL 1 (best)14.47□□□□□ -0.099e-11■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 SNHG12-205ENST00000470977 1098 ntTSL 1 (best)12.61□□□□□ -0.399e-11■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 SNHG12-211ENST00000488745 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.979e-11■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.346e-15■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 ANXA1-204ENST00000456643 799 ntTSL 55.04□□□□□ -1.63e-6■■■■□ 20.9
RBM22Q9NW64 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.972e-6■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 PFKFB4-206ENST00000422701 636 ntTSL 315.76■□□□□ 0.116e-7■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 PFKFB4-215ENST00000496767 779 ntTSL 515.3■□□□□ 0.046e-7■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 FBRS-208ENST00000543786 2890 ntTSL 214.5□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 AP1G2-216ENST00000554982 716 ntTSL 412.81□□□□□ -0.361e-7■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 AP1G2-217ENST00000555118 362 ntTSL 512.29□□□□□ -0.441e-7■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 AP1G2-229ENST00000557132 474 ntTSL 312.29□□□□□ -0.441e-7■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 AP1G2-230ENST00000557162 561 ntTSL 410.31□□□□□ -0.761e-7■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 AP1G2-212ENST00000554554 2955 ntTSL 210.02□□□□□ -0.81e-7■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 HDLBP-225ENST00000452931 801 ntTSL 58.85□□□□□ -0.991e-6■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 TNFRSF10B-204ENST00000519028 612 ntTSL 220.66■□□□□ 0.98e-8■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 TNFRSF10B-205ENST00000519910 546 ntTSL 413.79□□□□□ -0.28e-8■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.175e-7■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.18e-7■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 NINJ1-203ENST00000470314 834 ntTSL 313.93□□□□□ -0.188e-7■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 NINJ1-202ENST00000461162 861 ntTSL 213.79□□□□□ -0.28e-7■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 PICALM-221ENST00000533350 541 ntTSL 32.36□□□□□ -2.031e-8■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 PLXNB2-202ENST00000411680 704 ntTSL 216.99■□□□□ 0.313e-7■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.133e-7■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.173e-7■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.199e-7■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.369e-7■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 HNRNPA2B1-206ENST00000490912 5328 ntTSL 215.38■□□□□ 0.056e-9■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 HNRNPA2B1-202ENST00000356674 1711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.516e-9■■■■□ 20.8
RBM22Q9NW64 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.979e-11■■■■□ 20.7
RBM22Q9NW64 IVD-203ENST00000479013 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.569e-11■■■■□ 20.7
RBM22Q9NW64 HNRNPA1-212ENST00000551679 359 ntTSL 25.6□□□□□ -1.512e-6■■■■□ 20.7
RBM22Q9NW64 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.244e-7■■■■□ 20.7
RBM22Q9NW64 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.394e-7■■■■□ 20.7
RBM22Q9NW64 OGT-210ENST00000488174 7243 ntTSL 56.18□□□□□ -1.424e-7■■■■□ 20.7
RBM22Q9NW64 MIDN-202ENST00000586757 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 524.53■■□□□ 1.521e-13■■■■□ 20.7
RBM22Q9NW64 PRDM16-204ENST00000463591 384 ntTSL 520.42■□□□□ 0.865e-6■■■■□ 20.7
RBM22Q9NW64 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.055e-6■■■■□ 20.7
RBM22Q9NW64 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.065e-6■■■■□ 20.7
RBM22Q9NW64 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.265e-6■■■■□ 20.7
RBM22Q9NW64 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.275e-6■■■■□ 20.7
RBM22Q9NW64 PRDM16-207ENST00000512462 3723 ntTSL 1 (best)12.27□□□□□ -0.455e-6■■■■□ 20.7
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