Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms