Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SERINC1Q9NRX5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms