Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR88Q9GZN0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms