Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX6-2Q9C056 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-2Q9C056 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms