Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms