Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms