Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms