Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms