Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD1Q96JS3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms