Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms