Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms