Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms