Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms