Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms