Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms