Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms