Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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