Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms