Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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UBE4AQ14139 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE4AQ14139 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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