Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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