Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
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