Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAMB3Q13751 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LAMB3Q13751 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms