Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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