Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1IP1Q13113 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms