Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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