Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms