Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms