Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms