Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms