Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCDC1P59894 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms