Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4P46934 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms