Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARCKSP29966 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARCKSP29966 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MARCKSP29966 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARCKSP29966 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MARCKSP29966 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MARCKSP29966 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MARCKSP29966 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MARCKSP29966 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARCKSP29966 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MARCKSP29966 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARCKSP29966 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MARCKSP29966 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARCKSP29966 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MARCKSP29966 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MARCKSP29966 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MARCKSP29966 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARCKSP29966 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARCKSP29966 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MARCKSP29966 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARCKSP29966 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARCKSP29966 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MARCKSP29966 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms