Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms