Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms