Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms