Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms