Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX58O95786 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX58O95786 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX58O95786 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX58O95786 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX58O95786 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX58O95786 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX58O95786 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX58O95786 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX58O95786 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX58O95786 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX58O95786 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX58O95786 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX58O95786 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX58O95786 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX58O95786 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX58O95786 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX58O95786 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX58O95786 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX58O95786 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX58O95786 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX58O95786 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX58O95786 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX58O95786 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX58O95786 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX58O95786 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX58O95786 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX58O95786 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX58O95786 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX58O95786 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX58O95786 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX58O95786 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX58O95786 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX58O95786 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX58O95786 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX58O95786 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX58O95786 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX58O95786 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX58O95786 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX58O95786 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX58O95786 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX58O95786 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX58O95786 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX58O95786 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX58O95786 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX58O95786 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX58O95786 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX58O95786 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX58O95786 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX58O95786 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX58O95786 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX58O95786 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX58O95786 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX58O95786 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX58O95786 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX58O95786 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX58O95786 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX58O95786 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX58O95786 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX58O95786 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX58O95786 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX58O95786 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX58O95786 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX58O95786 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX58O95786 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX58O95786 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX58O95786 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX58O95786 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX58O95786 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX58O95786 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX58O95786 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms