Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA10O75578 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms