Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPHP4O75161 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPHP4O75161 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NPHP4O75161 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPHP4O75161 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPHP4O75161 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPHP4O75161 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NPHP4O75161 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPHP4O75161 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NPHP4O75161 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPHP4O75161 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPHP4O75161 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPHP4O75161 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPHP4O75161 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPHP4O75161 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms