Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms