Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBDO15205 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBDO15205 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBDO15205 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBDO15205 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBDO15205 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBDO15205 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBDO15205 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
UBDO15205 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBDO15205 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms