Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BCKDKO14874 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms